Dans un monde où la magie est omniprésente, seuls les plus talentueux sont admis à l'Académie des Arcanes, une prestigieuse école située au cœur d'une cité flottante dissimulée dans les nuages. Chaque étudiant est formé pour maîtriser un type spécifique de magie, des éléments naturels à la manipulation du temps, en passant par la lecture des pensées. L'histoire suit Céleste, une jeune fille issue d'une famille sans pouvoir magique. Contre toute attente, elle est acceptée à l'Académie après avoir manifesté un pouvoir extrêmement rare : la magie du Néant, une forme de magie interdite depuis des siècles pour son potentiel destructeur.