Sur l'île top secrète d'Atlantis, les individus ayant des capacités surnaturelles sont confinés depuis des années par les gouvernements du monde entier. Sans aucun espoir de s'échapper, ou de communiquer avec le reste du monde, des communautés se sont formées et essaient de survivre. Mais un jour, les ravitaillement aériens cessent, les avions de chasse ne passent plus et les bateaux de guerre disparaissent des côtes. Face à ce changement soudain, l'île se divise: Faut-il en profiter pour s'échapper? Ou bien s'adapter pour survivre et rester sur l'île? Izzy et Gabe ont déjà fait leur choix, ils veulent retrouver le monde qu'ils ont connu enfants et sont prêt à tout pour cela, même à tenter de vaincre Malakith le dangereux maître de l'île qui s'oppose à toute fuite.